35 anni dopo essere stato proposto alle giovani generazioni, torna "Capitan Harlock" sotto forma di pellicola cinematografica in 3D. "Harlock: Space Pirate", presentato fuori concorso al Festival del Cinema di Venezia, e' frutto di un lungo lavoro: ci sono voluti cinque anni di discussione per far partire il progetto. Inventato nel 1976 da Leju Matsumoto, nel 1978 fu trasportato sul piccolo schermo in una serie tv che spopolo' in Italia.
"L'idea di partenza - spiega il regista Shinij Aramaki - era di fare un film d'intrattenimento per un pubblico internazionale. Allo stesso tempo, tuttavia, volevo che fosse un commento ai problemi che stiamo affrontando in Giappone, usando il genere fantascientifico. Harlock è un pirata, ossia uno che si ribella contro il sistema. Ciò, naturalmente, tende a renderlo un eroe oscuro, un "antieroe", se vogliamo, proprio come Batman2.

Capitan Harlock è l'unico uomo che si interpone fra la corrotta Coalizione Gaia e il tentativo di un completo dominio intergalattico da parte di quest'ultima. In cerca di vendetta contro coloro che hanno defraudato lui e l'umanità, il misterioso pirata dello spazio vaga nell'universo a bordo del suo incrociatore da battaglia, l'Arcadia, attaccando e saccheggiando con audacia le navi nemiche. Ezra, comandante della Flotta di Gaia, ordina al fratello minore Logan di infiltrarsi nell'Arcadia e uccidere Harlock. Ma Logan scopre presto che a volte le cose non sono come sembrano e che la nascita di una leggenda avviene sempre per un valido motivo. Harlock spinge il suo leale equipaggio a proseguire nella rischiosissima missione di disfare i "Nodi del Tempo" e riportare la Terra all'epoca in cui era ancora abitata dagli uomini. È l'anno 2977 e 500 miliardi di profughi umani sognano di ritornare sul pianeta che ancora chiamano patria. Il ribelle Capitan Harlock e il suo fidato equipaggio sono per loro l'unica speranza di raddrizzare un giorno i torti inflitti dalla Coalizione.